　清水寺は、永正年中（1504-20）、印融法印が開いた檀林（学問所）の古地に、当時今川8代守護大名氏輝の遺命によって永禄2年（1559）家臣の朝比奈丹波守元長が創建したものである。開山は、京都から迎えられた尊寿院大僧正道因と伝えられている。この地の眺望がすばらしく、京都の音羽山清水寺に似ていたので、その名がつけられた。
　境内には、慶長7年（1602）徳川家康が建立した観音堂をはじめ、薬師堂、聖天堂・霊牌、金比羅神社、熊野神社などがある。観音堂の中には、同じ頃に建立されたと思われる禅宗様の宮殿型厨子が安置されている。いずれも安土桃山時代の建築様式を伝え、昭和31年5月に県の文化財に指定されている。