素戔嗚命を主神とし、相殿に関白藤原兼家を祀る。桓武天皇が平安京を造営した際、大内裏鎮護のため四方四隅に祀られた大将軍神社のうち、東南隅の一つである。
　特に平安京東のこの地は、三条口の要地にあたり、邪霊の侵入を防ぐ意を以て重要視されてきた。
　この辺りに建てられた藤原兼家邸は、応仁の乱で廃絶したが、境内に東三条社として名跡を留めている。また、樹齢800年と伝える銀杏の大樹があり、かつては鵺（ぬえ）の森とも呼ばれ、源頼政の鵺退治の伝説を偲ばせる。