　社伝によると天智天皇が大津の宮に遷都の際、この地を御厨所と定められた。
　天武天皇6年（677）に大和の国から御食津神を奉遷して、大膳職の御厨神とされた。
　慶長年間（1596-1614)に至り大政所、豊臣秀頼、徳川家康などが当社を厚く尊信されて種々の神器の寄進があり、東山天皇は膳所大明神の宣下をされました。
　また、慶長6年(1601)膳所城創始以来、歴代の藩主本多候は崇敬が厚く、社領の寄進や社殿の造営が度々行われました。
　現在の当社表門は、旧膳所城の城門で重要文化財に指定されています。