　禅宗の一派の黄檗宗の末寺であるが、歴史的に明らかなのは、江戸時代に黄檗宗の寺院となってからである。
　戦国時代、織田信長の兵火により焼失したが、村人たちが観音堂を建て、本尊千手観音像をお祀りしていた。
　その後、元文2年（1737）黄檗宗の僧鎮堂が旅の途中、四日市で一泊した折、夢枕に現れた老人のお告げにより、この地に新しく寺を建て観音寺とした。
　村人たちによって兵火から守られた千手観音像は本堂に今も安置されており、頭体幹部は11世紀頃の制作であろうといわれている。
　山門は四脚門方式で、屋根の両端に異国風の　「魔伽羅」（サンスクリット語で鰐）が飾られているが、これは黄檗宗特有のものである。黄檗宗大本山宇治萬福寺の諸堂にもこの「魔伽羅」が見られる。
　当観音寺の「魔伽羅」は、棟札より寛政12年（1800）に置かれたものであることが分かる。細部の絵様は本堂のものと一致している。