　本社の祭神は初め天児屋根命（あめのこやねみこと）と天太玉命（あめおふとたまのみこと）であり、上古にこの二柱の神が禁裏御料地の山階郷柳山に降臨座されたので揚柳大明神と奉称した。そもそも、この二柱の神は天孫降臨時に左右を補佐した神であるところから両羽大明神とも称し奉った。
　人皇第56代清和天皇の御世の貞観4年（862）に禁裏御所により社殿が造営され、両羽大明神と唱え給い、裏山の名も両羽山と称するに至った。
　中古の後柏原天皇の御世の永正年間より中央に八幡宮、左に伊弉諾命を、右に素戔嗚命及び若宮八幡宮を配し、以上6社を合祀した。
　よって両羽の文字を諸羽と改称する。往古の社殿は応仁の乱の兵火により、又その後再建された社殿も江戸中期明和年間の大火により焼失した。
　同期明和5年氏子中より募財して、3度目の造営がなされ今日に到る。
　従前は皇室との関係が深く御崇敬を賜った。
　明治に至り郷社の社格を受ける。古来山科18郷中四宮、安朱、竹鼻の産土神として親しまれている。