　善休寺は、天台宗の流れを汲む寺院であり光曉坊と称していた。
　貞永元年（1232）頃親鸞聖人関東より御上洛の途次、葉栗郡門間の庄・木瀬（現在の岐南町三宅木瀬）の草庵に滞在の折、当時天台宗光曉坊念願法師が当山への来駕を仰ぎ御化導を賜り、以後浄土真宗となる。なお、慶長時代（1596-1615）に光曉坊より善休寺と改名し今日に至る。
　当山は、織田信長にゆかりの深い本光院（京都市上京区七本松）の帰依深く筋堀（塀に三本筋入り）を許され菊花紋入りの品を寄付され祈願所と定められる。
　また、尾張徳川家が各務野にて狩りの折り、当山を宿所として以来信仰篤く、特別に「葵の紋」を賜る。